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viral_seq 1.10.2

A Ruby Gem with bioinformatics tools for processing viral NGS data. Specifically for Primer-ID sequencing and HIV drug resistance analysis.

Gemfile:
=

installation:
=

Versions:

  1. 1.10.2 July 21, 2025 (3,6 Mo)
  2. 1.10.0 May 02, 2025 (3,6 Mo)
  3. 1.9.1 December 02, 2024 (3,6 Mo)
  4. 1.9.0 November 14, 2024 (3,6 Mo)
  5. 1.8.1.1 June 04, 2024 (3,59 Mo)
Voir toutes les versions (53)

Dépendances de Runtime (7):

colorize ~> 0.1
combine_pdf ~> 1.0, >= 1.0.0
muscle_bio = 0.4
prawn ~> 2.3, >= 2.3.0
prawn-table ~> 0.2, >= 0.2.0
shellwords ~> 0.2
virust-locator-ruby ~> 0.3

Dépendances de Development (3):

bundler ~> 2.5
rake ~> 13.0
rspec ~> 3.0
Show all transitive dependencies

Dépendances:

R required for some functions

Propriétaires:

Pushed by:

Auteurs:

  • Shuntai Zhou, Michael Clark

Total de contrôle SHA 256:

=
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Total de téléchargements 65 396

Pour cette version 257

Version publiée:

License:

MIT

Version de Ruby requise: >= 2.5

Required Rubygems Version: >= 1.3.6

Liens:

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