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viral_seq 1.10.3

A Ruby Gem with bioinformatics tools for processing viral NGS data. Specifically for Primer-ID sequencing and HIV drug resistance analysis.

Gemfile:
=

installation:
=

Versions:

  1. 1.10.3 December 11, 2025 (3,6 Mo)
  2. 1.10.2 July 21, 2025 (3,6 Mo)
  3. 1.10.0 May 02, 2025 (3,6 Mo)
  4. 1.9.1 December 02, 2024 (3,6 Mo)
  5. 1.9.0 November 14, 2024 (3,6 Mo)
Voir toutes les versions (54)

Dépendances de Runtime (7):

colorize ~> 0.1
combine_pdf ~> 1.0, >= 1.0.0
muscle_bio = 0.4
prawn ~> 2.3, >= 2.3.0
prawn-table ~> 0.2, >= 0.2.0
shellwords ~> 0.2
virust-locator-ruby ~> 0.3

Dépendances de Development (3):

bundler ~> 2.5
rake ~> 13.0
rspec ~> 3.0
Show all transitive dependencies

Dépendances:

R required for some functions

Propriétaires:

Pushed by:

Auteurs:

  • Shuntai Zhou, Michael Clark

Total de contrôle SHA 256:

=
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Pour cette version 162

Version publiée:

License:

MIT

Version de Ruby requise: >= 2.5

Required Rubygems Version: >= 1.3.6

Liens:

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